登録が重なっても特に問題はありません。
両方に処方を登録してしまいますと重複請求してしまう可能性が出てきます（チェックをせずに提出してしまうと）。

一度登録してしまった患者さんデータの消去は出来ません（誤って消去してしまった場合の問題の方が大きいですので）。
ただ、上書きして他の患者さんのデータに変更することは出来ますので、新しい患者さんがいらした時に変更してご利用ください。