＞「不要なレセプト情報のレコードが記録されています」
ということは、記載しなくてよいコードが、入っているのでしょう。レセプトを点検する必要があります。考えられるのは下記の項目では？

特記事項にコードが記入されていないでしょうか？
特記事項があっても、「特記事項に記入しない」という県もありますので、この点はどうなんでしょう。