雑木さん、こんにちは。
ちょっと安心しました。

原因を考えるに、３月中に診療報酬情報提供サービスからアップされたファイルには、３月で経過措置が切れる薬品が前のコードが生きたまま（当然旧薬価のまま）載っていたのではないかと思われます。

電子レセになると、経過措置品の問題が大きくなります。
印刷上は問題なく通ってしまうケースが、チェックにかかってきます。

そのあたりも含めて、バージョン３は対応していくようお願いしてあります。