> 公費欄の数字に間違いはありませんでした。

公費欄にも乳障母傷欄にも何も入力なしの状態ということでしょうか。
それですと、ちょっと状況が想像できません。

一度、他の方のデータ（テストデータを作成していただいても結構です）で試していただきたいのですが、処方編集画面で［保険公費］をクリックしていただくとその処方の調剤日時点での保険番号などが表示されます。そこの「一部負担金の割合」の数字を変えて見てください。数字を変えるごとに負担金額が変化するはずです。